Марат Раисович Айнетдинов в 1991 году окончил социально-экономический факультет Института стран Азии и Африки МГУ им. М.В. Ломоносова.
В 1993 году проходил стажировку в крупнейших британских страховых компаниях.
В 1992 году работал экспертом в отделе транспортного страхования грузов ОСАО «Россия».
В 1994 году – начальником отдела по страхованию строительно-монтажных рисков СОАО «Русский страховой центр».
В 1996 году возглавил отдел представительства международного страхового брокера Aon в России.
В 1998 году был назначен генеральным директором ОАО СК «Прогресс-Гарант» (до 2000 года – «ЮКОС-Гарант»). В 2001 году стал президентом страховой группы «Прогресс».
В октябре 2002 года вступил в должность генерального директора ОСАО «Россия». В сентябре 2005 года оставил пост руководителя и продолжил работу в совете директоров компании.
После продажи ОСАО «Россия» в сентябре 2008 года УК «Трастком» занял пост генерального директора ОАО «Русская страховая компания» (РСК), который занимал до конца того же года.
Являлся вице-президентом Всероссийского союза страховщиков (ВСС).
В июле 2007 года стал одним из создателей компании InSelia – дистрибьютора розничных страховых услуг.
Впоследствии – генеральным директором ООО Финансовая группа «Инселия».